named が、過負荷(？)で、落ちた後、一部のドメインが、接続できなくなっていました。
ドメイン名を nslookup してみると
**Sever can’t find example.jp SERVFAIL
エラーが、発生するようになりました。
このドメインは、DDNS運用していたため、ZONEファイルのジャーナルファイル(.jnl)があり、整合性が、おかしくなって発生していました。
下記のコマンドで、復旧しました。
sudo rndc freeze
sudo rndc thaw
もちろん、 ジャーナルファイル(.jnl) を削除して、 named を再起動しても 復旧されます。